Преподаватель: Елена Шушкевич (tg: @ElenaShush, e-mail: eshushkevich@yandex.ru).
Когда: среда, 6-7 уроки.

Описание курса

В последние десятилетия биологическая наука пережила настоящую революцию. Всё началось с появления технология секвенирования — метода, позволяющего «прочитать» генетическую информацию, хранящуюся в клетках живых организмов. Это открытие открыло совершенно новые возможности в изучении жизни.

С каждым годом объём генетических данных стремительно растёт. Для их обработки потребовались специальные методы — статистический анализ и программирование. На стыке этих дисциплин возникла новая научная область — биоинформатика.

На нашем курсе вы освоите основные этапы работы с генетической информацией. Мы подробно разберем процесс секвенирования ДНК, а также методы визуализации и анализа полученных данных.

Программа обучения включает:
– Первичный анализ — проверка качества секвенирования
– Сборка генома из отдельных фрагментов ДНК
– Аннотирование генома — определение местоположения генов и их функций
– Практическое исследование генов цикла Кальвина

Далее в курсе вы освоите методы сравнительной геномики. Вы научитесь:
– Находить родственные гены с помощью программы BLAST
– Разбираться в различных алгоритмах выравнивания генов и построения филогенетических деревьев
– Строить филогенетические деревья
– Решать прикладные задачи (найдём ближайших сухопутных родственников китов и проверим, действительно ли киты относятся к млекопитающим, а не рыбам)

В заключительной части курса мы перейдем к изучению микробиомов. Вы освоите методы сравнения микробных сообществ и сможете принять участие в исследовательском проекте по анализу микробиомов северных морей России.

Курс сочетает теоретические знания с практическими навыками.