Биоинформатика
Преподаватель: Елена Шушкевич (tg: @ElenaShush, e-mail: eshushkevich@yandex.ru).
Когда: суббота.
Описание курса
На нашем курсе вы освоите основные этапы работы с генетической информацией. Мы подробно разберем процесс секвенирования ДНК — технологию «прочтения» генетического кода, а также методы визуализации и анализа полученных данных.
Программа обучения включает:
– Первичный анализ — проверка качества секвенирования
– Сборка генома из отдельных фрагментов ДНК
– Аннотирование генома — определение местоположения генов и их функций
– Практическое исследование генов цикла Кальвина
Далее в курсе вы освоите методы сравнительной геномики. Вы научитесь:
– Находить родственные гены с помощью программы BLAST
– Разбираться в различных алгоритмах выравнивания генов и построения филогенетических деревьев
– Строить филогенетические деревья
– Решать прикладные задачи (найдём ближайших сухопутных родственников китов и проверим, действительно ли киты относятся к млекопитающим, а не рыбам)
В заключительной части курса мы перейдем к изучению микробиомов. Вы освоите методы сравнения микробных сообществ и сможете принять участие в исследовательском проекте по анализу микробиомов северных морей России.
Курс сочетает теоретические знания с практическими навыками.